De Autocarro
- 58, 773 em frente ao Museu
- 6, 9, 74, 720, 727 e 738 no Largo do Rato (a 300 m)
- 92, 790 no Príncipe Real (a 200 m)
- O Museu dispõe de um espaço reservado na via pública para os autocarros largarem os grupos escolares, situado entre as entradas do Museu e do Jardim Botânico, mas nem sempre os restantes condutores respeitam os sinais de proibição aí existentes.
De Metro
- Estação do Rato (Linha Amarela)
De Carro
- O Museu fica localizado numa das ruas mais movimentadas de Lisboa. A Rua da Escola Politécnica tem sempre um tráfego automóvel intenso em ambos os sentidos.
- O Museu não dispõe de parque para os visitantes e normalmente não há lugares de estacionamento disponíveis na via pública.
- Sugere-se a quem se desloque de automóvel que estacione no parque da Rua da Escola Politécnica (em frente à Procuradoria Geral da República) ou no parque da Rua do Salitre.